Resumen

La crio-microscopía electrónica es una técnica que busca obtener la estructura tridimensional de proteínas y complejos macromoleculares. Para ello se adquieren imágenes de transmisión mediante un microscopio electrónico de una muestra. Estas imágenes presentan una relación señal-ruido extremadamente baja. A pesar de ello, haciendo uso de técnicas de procesado de imagen es posible obtener una estructura tridimensional compatible con las imágenes adquiridas. Debido al gran ruido de las imágenes es preciso determinar el grado de fiabilidad espacial de las reconstrucciones, es decir, la resolución. Si bien este concepto es intuitivo su definición es compleja. Generalmente se define como el tamaño estructural más pequeño presente en la reconstrucción. La métrica para medir la resolución es la Fourier Shell Correlation o FSC, y consiste en una correlación normalizada entre dos reconstrucciones independientes obtenidas cada una de ellas con la mitad de los datos. La FSC puede extenderse de manera local para tratar de medir la resolución local de determinadas zonas de la proteína reconstruida. De manera análoga se puede extender para medir la resolución a lo largo de distintas direcciones. Así es posible descubrir que las reconstrucciones muestran una anisotropía de calidad o de resolución. Esto generalmente se debe a la existencia de orientaciones preferentes de la proteína. Desafortunadamente la FSC no permite medir la resolución y la anisotropía de manera simultánea. En esta charla se presenta la Fourier Shell Ocuppancy (FSO), que muestra una generalización de la FSC, permitiendo de manera intuitiva medir la resolución y la anisotropía de resolución de las reconstrucciones. En particular, la FSO mide la cantidad de información presente en la reconstrucción a distintas frecuencias.

Imparte

Dr. José Luis Vilas

Unidad de Biocomputación del Centro Nacional de Biotecnología, CSIC, Madrid, España.